閉式冷卻塔利用水系統工作散熱。盤管中的水蒸發，一方面散熱，另一方面也造成了水中雜質濃度升高、微生物大量繁殖等問題。雜質增多和微生物繁殖會造成盤管表面的水垢增多，擋水板和鍍鋁鋅板表面的覆蓋雜質增多，進而導致系統散熱慢、冷卻效率減少，腐蝕冷卻塔設備，減少冷卻塔的使用壽命。
它的封閉結構是產生里面水垢的根本原因。它的工作水在曲折的盤管列陣中與空氣、噴淋水進行熱交換，長期的閉路致使水中雜質不能被排出，水量的減少加速了雜質濃度的升高過程，高溫環境滋生大量的微生物。這些根部性問題的發生和發展，要導致盤管里結垢，產生弱酸性物質，腐蝕管體和水道。
它的金屬材料在設備停用期間，因空氣侵入而被腐蝕；冷卻塔運行期間，水中溶解物會對金屬產生腐蝕作用。這樣形成的腐蝕性水垢，對冷卻塔的外壁和里面元件產生了嚴重的破壞作用，影響冷卻塔使用壽命。
它的盤管在清潔狀態下，傳遞出來的熱量可以直接與空氣和水進行交換，散熱好，冷卻效能高。如果盤管內外存在水垢，熱量透過水垢，再傳遞給空氣和水，而水垢的熱傳遞效率低，成片的水垢出現，會嚴重影響冷卻塔的散熱性能，導致冷卻塔達不到散熱降溫的效力。
手動添加清理劑，及時處理突發事況。
閉式冷卻塔同其它冷卻塔一樣，可進行手動配置稀鹽酸，清洗除垢的工作。它在清理水垢配置稀鹽酸的時候，要根據計算公式進行計算，不可根據經驗來操作，鹽酸濃度過高剩余會造成對銅管和鋼管的腐蝕。在除去完成后要運行一段時間再投入到工業使用當中。在清理完成后，要對設備的完整性進行檢查，確認設備再使用。
